O Conselho da Faculdade de Educação é a instância máxima de deliberação da Unidade Acadêmica. É presidido pelo Diretor (a) e congrega a Direção e Vice-direção, as Chefias e Representações Docentes de cada um dos três Departamentos, os Coordenadores de Extensão, Graduação e Pós Graduação, bem como os representantes da FE nos Conselhos superiores da UnB - Conselho Universitário – CONSUNI, Conselho de Ensino Pesquisa e Extensão – CEPE, Conselho de Administração – CAD. Representante na Câmara de Carreira Docente - CCD, na Câmara de Assuntos Comunitários – CAC, representantes de discentes de graduação e de pós-graduação assim como representante dos servidores técnicos administrativos.

As Coordenações possuem, respectivamente, as Câmaras de Graduação, de Extensão e de Pós-graduação, como instâncias de deliberação.